26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2172 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  85.29 
 
 
401 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  85.54 
 
 
401 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  98.25 
 
 
401 aa  823    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  100 
 
 
401 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  98.25 
 
 
401 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  30.88 
 
 
397 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  30.64 
 
 
397 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  24.35 
 
 
414 aa  130  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  25.31 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  30.4 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  29.52 
 
 
394 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  30.4 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  24.56 
 
 
393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  23.49 
 
 
392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  24.23 
 
 
392 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  23.88 
 
 
395 aa  103  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  31.29 
 
 
414 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  20.42 
 
 
386 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  28.51 
 
 
389 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  32.82 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  31.97 
 
 
391 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  29.93 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  29.93 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  30.08 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  31.51 
 
 
426 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  41.82 
 
 
114 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>