26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0103 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  853    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  33.25 
 
 
414 aa  219  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  30.77 
 
 
384 aa  162  9e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  30.28 
 
 
384 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  25.78 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  27.34 
 
 
393 aa  145  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  27.91 
 
 
426 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  27.19 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  26.47 
 
 
386 aa  140  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  26.38 
 
 
394 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  25.9 
 
 
395 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  26.67 
 
 
394 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  26.73 
 
 
392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  25.42 
 
 
392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  24.35 
 
 
401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  23.75 
 
 
401 aa  129  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  23.19 
 
 
401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  24.32 
 
 
401 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  24.32 
 
 
401 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  28.21 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  25.22 
 
 
459 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  22.25 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  21.99 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  24.74 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  25.06 
 
 
391 aa  80.9  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  36.63 
 
 
114 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>