30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1348 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  832    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  99.5 
 
 		 397 aa  828    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  31.13 
 
 		 401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  31.13 
 
 		 401 aa  223  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  30.64 
 
 		 401 aa  222  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  30.64 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  30.39 
 
 		 401 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  30.03 
 
 		 394 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  29.46 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  29.19 
 
 		 394 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  29.55 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  27.99 
 
 		 393 aa  150  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  29.67 
 
 		 394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  26.62 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  27.59 
 
 		 392 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  25 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  21.99 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  32.61 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  31.1 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  32.84 
 
 		 384 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  26.42 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  32.84 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  22.75 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  31.58 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0259  lateral flagellar associated protein LafV  24.67 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0194  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  25.88 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0702448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  25.1 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0146  hypothetical protein  25.66 
 
 		 311 aa  50.8  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3375  hypothetical protein  23.67 
 
 		 309 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  26.67 
 
 		 114 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>