28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0763 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  100 
 
 
394 aa  827    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  76.73 
 
 
393 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  55.36 
 
 
395 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  50.51 
 
 
392 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  48.6 
 
 
394 aa  408  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  49.23 
 
 
394 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  48.85 
 
 
394 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  47.19 
 
 
392 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  30.03 
 
 
397 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  30.03 
 
 
397 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  25.78 
 
 
414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  26.21 
 
 
414 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  25.31 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  25.06 
 
 
401 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  25.06 
 
 
401 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  24.75 
 
 
401 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  24.75 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  23.54 
 
 
384 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  37.8 
 
 
384 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  26.71 
 
 
382 aa  97.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  32.92 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  37.8 
 
 
389 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  37.8 
 
 
459 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  33.89 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  28.38 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  32.29 
 
 
114 aa  59.7  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0146  hypothetical protein  24.64 
 
 
311 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0194  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  26.29 
 
 
311 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0702448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>