28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3456 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 395 aa  824    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  55.36 
 
 		 394 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  56.27 
 
 		 393 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  45.41 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  47.46 
 
 		 394 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  46.19 
 
 		 394 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  46.19 
 
 		 394 aa  381  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  44.64 
 
 		 392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  29.55 
 
 		 397 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  29.55 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  25.9 
 
 		 414 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  24.24 
 
 		 414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  30.67 
 
 		 384 aa  106  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  30.94 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  23.88 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  24.06 
 
 		 401 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  24.06 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  22.99 
 
 		 401 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  22.99 
 
 		 401 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  37.01 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  35.97 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  34.29 
 
 		 459 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  32.58 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  43.21 
 
 		 114 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  31.62 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  21.23 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0194  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  23.75 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0702448  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  40.74 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>