28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3820 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  76.73 
 
 		 394 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  100 
 
 		 393 aa  819    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  56.27 
 
 		 395 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  48.59 
 
 		 392 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  46.45 
 
 		 394 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  46.84 
 
 		 394 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  47.97 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  45.78 
 
 		 392 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  28.24 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  27.99 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  27.34 
 
 		 414 aa  145  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  25.65 
 
 		 414 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  24.56 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  24.56 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  24.87 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  23.75 
 
 		 401 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  23.81 
 
 		 401 aa  106  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  42.2 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  42.2 
 
 		 384 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  40.94 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  38.52 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  25.16 
 
 		 382 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  34.31 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  24.62 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  33.57 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  36 
 
 		 114 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0194  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  23.75 
 
 		 311 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0702448  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0146  hypothetical protein  24.79 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>