26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0316 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  100 
 
 
386 aa  786    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  29.12 
 
 
389 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  26.47 
 
 
414 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  24.94 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  26.79 
 
 
384 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  25.92 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  23.87 
 
 
414 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  37.01 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  35.07 
 
 
394 aa  97.8  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  32.92 
 
 
394 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  35.07 
 
 
394 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  35.07 
 
 
394 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  31.85 
 
 
392 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  20.42 
 
 
401 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  31.84 
 
 
391 aa  87.8  3e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  34.31 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  20.16 
 
 
401 aa  86.7  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  21.77 
 
 
401 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  29.46 
 
 
401 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  27.34 
 
 
401 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  29.2 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  31.16 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  26.42 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  36.67 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  24.4 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  34.02 
 
 
114 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>