26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0878 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  100 
 
 		 389 aa  774    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  74.29 
 
 		 459 aa  601  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  28.99 
 
 		 386 aa  170  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  27.06 
 
 		 384 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  28.76 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  28.21 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  32.52 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  23.59 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  40.94 
 
 		 393 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  28.61 
 
 		 382 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  25 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  37.8 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  35.07 
 
 		 394 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  34.33 
 
 		 394 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  35.97 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  35.77 
 
 		 394 aa  90.1  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  35.2 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  32.86 
 
 		 401 aa  86.7  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  32.86 
 
 		 401 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  25.96 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  28.51 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  29.69 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  28.51 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  22.27 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  42.65 
 
 		 114 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>