28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0750 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  816    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  55.47 
 
 		 394 aa  476  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  54.96 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  53.83 
 
 		 392 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  55.1 
 
 		 394 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  47.19 
 
 		 394 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  45.78 
 
 		 393 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  44.64 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  27.85 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  27.59 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  27.51 
 
 		 414 aa  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  25.12 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  23.56 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  23 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  23.06 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  22.53 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  22.53 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  34.65 
 
 		 459 aa  87  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  35.2 
 
 		 389 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  31.11 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  25.89 
 
 		 386 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  30.37 
 
 		 384 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  27.03 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  25.08 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  36.84 
 
 		 114 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  32.82 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  35.62 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0194  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  23.77 
 
 		 311 aa  43.1  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0702448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>