27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1286 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  100 
 
 		 401 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  99.5 
 
 		 401 aa  834    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  85.54 
 
 		 401 aa  723    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  85.29 
 
 		 401 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  85.54 
 
 		 401 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  31.13 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  31.13 
 
 		 397 aa  222  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  24.32 
 
 		 414 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  24.82 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  24.75 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  23.9 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  23.64 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  29.07 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  38.13 
 
 		 392 aa  106  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  23.75 
 
 		 393 aa  106  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  22.99 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  32.52 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  33.57 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  32.86 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  27.34 
 
 		 386 aa  86.3  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  32.33 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  32 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  32.28 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  30.95 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  32.19 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  30.61 
 
 		 114 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0259  lateral flagellar associated protein LafV  22.33 
 
 		 309 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>