26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0986 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  100 
 
 
459 aa  910    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  74.29 
 
 
389 aa  601  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  24.89 
 
 
386 aa  133  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  40.41 
 
 
414 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  25.22 
 
 
414 aa  103  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  36.3 
 
 
392 aa  96.7  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  38.52 
 
 
393 aa  95.5  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  39.67 
 
 
384 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  34.33 
 
 
394 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  37.8 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  33.58 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  39.67 
 
 
384 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  36.24 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  34.96 
 
 
394 aa  87.8  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  33.57 
 
 
401 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  34.29 
 
 
395 aa  87.8  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  33.57 
 
 
401 aa  87.4  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  34.65 
 
 
392 aa  87.4  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  32.61 
 
 
397 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  31.16 
 
 
397 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  32.82 
 
 
401 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  32.82 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  32.82 
 
 
401 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  34.81 
 
 
391 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  42.65 
 
 
114 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  31.94 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>