26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2119 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  85.54 
 
 
401 aa  724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  85.79 
 
 
401 aa  726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  98.5 
 
 
401 aa  826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  98.25 
 
 
401 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  100 
 
 
401 aa  836    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  30.88 
 
 
397 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  30.64 
 
 
397 aa  222  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  23.19 
 
 
414 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  25.06 
 
 
394 aa  125  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  24.28 
 
 
394 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  23.76 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  30.4 
 
 
394 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  24.87 
 
 
393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  23.73 
 
 
392 aa  113  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  23.27 
 
 
392 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  24.06 
 
 
395 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  30.67 
 
 
414 aa  93.6  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  21.77 
 
 
386 aa  86.3  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  28.51 
 
 
389 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  32.65 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  32.82 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  29.93 
 
 
384 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  29.93 
 
 
384 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  30.83 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  32.19 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  40 
 
 
114 aa  46.6  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>