29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0477 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  100 
 
 
394 aa  828    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  86.8 
 
 
394 aa  736    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  98.98 
 
 
394 aa  821    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  64.63 
 
 
392 aa  568  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  54.96 
 
 
392 aa  455  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  48.6 
 
 
394 aa  408  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  46.45 
 
 
393 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  46.19 
 
 
395 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  29.19 
 
 
397 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  29.19 
 
 
397 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  26.67 
 
 
414 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  23.7 
 
 
401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  23.76 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  29.52 
 
 
401 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  23.9 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  23.9 
 
 
401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  22.79 
 
 
414 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  22.05 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  35.07 
 
 
386 aa  94  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  34.33 
 
 
389 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  33.82 
 
 
384 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  33.58 
 
 
459 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  22.9 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  32.31 
 
 
382 aa  63.5  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  35.9 
 
 
114 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  31.01 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0194  queuine/archaeosine tRNA-ribosyltransferase  24.06 
 
 
311 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0702448  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  40.74 
 
 
444 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0146  hypothetical protein  21.69 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>