26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0797 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0797  FliB family protein  100 
 
 		 414 aa  828    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000597976  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0103  hypothetical protein  33.25 
 
 		 414 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0786  FliB domain-containing protein  100 
 
 		 114 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.147439  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0992  hypothetical protein  33.17 
 
 		 384 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.337219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1156  lysine-N-methylase-like protein  33.42 
 
 		 384 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.609349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0763  flagellar biosynthesis protein, putative  26.21 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3820  flagellar biosynthesis protein, putative  25.65 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00128187  hitchhiker  0.000153711 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0750  hypothetical protein  25.12 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3456  flagellar biosynthesis protein, putative  24.24 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0533  flagellar biosynthesis protein, putative  24.94 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0663  hypothetical protein  26.58 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3863  flagellar biosynthesis protein, putative  22.79 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0878  FliB family protein  26.38 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0118087  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0477  flagellar biosynthesis protein, putative  22.79 
 
 		 394 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1272  FliB family protein  28.25 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.588327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4160  flagellar biosynthesis protein, putative  22.49 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0986  fliB domain-containing protein  40.41 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1481  hypothetical protein  27.85 
 
 		 382 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00190464  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0316  FliB family protein  24.34 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2113  lysine-N-methylase  24.62 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0582721 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1163  lysine-N-methylase  32.52 
 
 		 401 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0865405  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2172  lysine-N-methylase  31.29 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00408267 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1286  lysine-N-methylase  32.52 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.172293  hitchhiker  0.00250753 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2119  lysine-N-methylase  30.67 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000610642 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1231  fliB family protein  23.18 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1348  hypothetical protein  22.75 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>