42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0442 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  329  1e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  68.21 
 
 
163 aa  224  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  68.21 
 
 
163 aa  224  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  68.87 
 
 
163 aa  223  7e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  58.45 
 
 
142 aa  179  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  36.14 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  33.94 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  34.48 
 
 
168 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  28.3 
 
 
179 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  26.8 
 
 
142 aa  49.7  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  28.26 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  34.02 
 
 
133 aa  48.9  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  32.65 
 
 
194 aa  48.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  29.29 
 
 
172 aa  48.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  26.97 
 
 
149 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  32 
 
 
173 aa  47.4  0.00008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  34.15 
 
 
156 aa  47.4  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  31.03 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  34.57 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  32.63 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  30.93 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  27.78 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  24.34 
 
 
221 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  26.19 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  33.72 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  38.55 
 
 
124 aa  44.7  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1546  hypothetical protein  52.5 
 
 
229 aa  44.3  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.231581  hitchhiker  0.0000778031 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  23.23 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  36.14 
 
 
246 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  35.8 
 
 
164 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  25.3 
 
 
152 aa  42.4  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  27.48 
 
 
138 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  32.35 
 
 
246 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  37.8 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  32 
 
 
163 aa  41.6  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  29.76 
 
 
113 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  34.57 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  29.25 
 
 
229 aa  41.6  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  36.59 
 
 
124 aa  41.2  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  29.9 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  26.44 
 
 
281 aa  40.8  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  31.68 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>