46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1944 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  313  4e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  146  8e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  51.01 
 
 
137 aa  141  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  52.14 
 
 
141 aa  141  3e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  51.08 
 
 
137 aa  140  8e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  48.54 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  50.54 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  40.59 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  37.65 
 
 
166 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  35.48 
 
 
229 aa  51.6  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  28.38 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  35.37 
 
 
222 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  31.21 
 
 
194 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  26.7 
 
 
210 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  34.69 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  26 
 
 
172 aa  47.4  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  34.15 
 
 
112 aa  47  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0824  hypothetical protein  32.35 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  30.1 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  28.43 
 
 
218 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  34.41 
 
 
240 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  40.96 
 
 
170 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  30.77 
 
 
246 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  32.18 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  31.96 
 
 
250 aa  45.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  33.66 
 
 
179 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  33.72 
 
 
163 aa  44.7  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  31.73 
 
 
175 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2522  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.245259  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  33.33 
 
 
163 aa  44.3  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  27.18 
 
 
271 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3592  protein of unknown function UPF0153  35.29 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  29.36 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  30.49 
 
 
221 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  33.33 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  28.1 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  31.31 
 
 
261 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  23.26 
 
 
224 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0589  Fe-S-cluster oxidoreductase-like  30.49 
 
 
220 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0309459  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  27.43 
 
 
236 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0165  hypothetical protein  42.5 
 
 
200 aa  40.8  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>