30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2539 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 116 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2522  protein of unknown function UPF0153  70.43 
 
 		 117 aa  181  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.245259  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3592  protein of unknown function UPF0153  68.7 
 
 		 117 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0589  Fe-S-cluster oxidoreductase-like  59.48 
 
 		 220 aa  160  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0309459  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2373  hypothetical protein  57.76 
 
 		 116 aa  159  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.960402  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3172  hypothetical protein  59.48 
 
 		 116 aa  155  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4540  protein of unknown function UPF0153  63.39 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2303  hypothetical protein  56.52 
 
 		 122 aa  147  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.798576  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1317  hypothetical protein  44.95 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1158  hypothetical protein  44.55 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.308257  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09261  Fe-S-cluster oxidoreductase  33.91 
 
 		 115 aa  97.4  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14501  Fe-S-cluster oxidoreductase  38.94 
 
 		 124 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0950  hypothetical protein  36.52 
 
 		 115 aa  97.1  8e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10181  Fe-S-cluster oxidoreductase  38.18 
 
 		 115 aa  95.1  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09121  Fe-S-cluster oxidoreductase  39.25 
 
 		 121 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.598462  hitchhiker  0.00000874271 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  38.18 
 
 		 115 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  34.69 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0954  hypothetical protein  44.19 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4386  protein of unknown function UPF0153  50 
 
 		 228 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  0.783994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1114  hypothetical protein  44.19 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0834  hypothetical protein  28.21 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000035633  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  38.1 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  38.46 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1877  hypothetical protein  37.29 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4743  hypothetical protein  57.69 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369246  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  32.31 
 
 		 97 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4057  hypothetical protein  57.69 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2061  hypothetical protein  36.67 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212538  normal  0.60183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  35.38 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  32.31 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>