24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4743 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4743  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  207  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369246  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0954  hypothetical protein  86.3 
 
 		 74 aa  137  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2546  hypothetical protein  73.81 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.211724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1114  hypothetical protein  86.3 
 
 		 74 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  76.25 
 
 		 100 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3321  hypothetical protein  63.83 
 
 		 96 aa  133  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  71.76 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2221  hypothetical protein  68.13 
 
 		 95 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2552  hypothetical protein  64.13 
 
 		 96 aa  130  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  62.24 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1930  hypothetical protein  61.46 
 
 		 100 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  54.26 
 
 		 97 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  68.75 
 
 		 104 aa  114  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003649  hypothetical protein  75.38 
 
 		 69 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4057  hypothetical protein  64.84 
 
 		 96 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2938  protein of unknown function UPF0153  47.67 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0781616  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04095  hypothetical protein  44.83 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1877  hypothetical protein  38.46 
 
 		 224 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  35.38 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1365  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  30.14 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0950  hypothetical protein  32.86 
 
 		 115 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  39.62 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4386  protein of unknown function UPF0153  41.18 
 
 		 228 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  0.783994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>