24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0504 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  273  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0348  hypothetical protein  80.92 
 
 		 145 aa  236  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5042  hypothetical protein  78.46 
 
 		 165 aa  233  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5092  hypothetical protein  78.46 
 
 		 134 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.637088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4916  hypothetical protein  78.46 
 
 		 134 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0467  hypothetical protein  78.46 
 
 		 151 aa  229  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0421  hypothetical protein  76.92 
 
 		 134 aa  226  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.887447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63680  hypothetical protein  68.46 
 
 		 164 aa  197  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5536  hypothetical protein  66.92 
 
 		 130 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45660  hypothetical protein  61.07 
 
 		 134 aa  180  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  61.74 
 
 		 119 aa  163  9e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3618  hypothetical protein  54.4 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0351  hypothetical protein  55.2 
 
 		 137 aa  159  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3669  hypothetical protein  54.4 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0357  hypothetical protein  54.4 
 
 		 137 aa  157  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  55.91 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  55.91 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  56.1 
 
 		 172 aa  151  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4354  Fe-S-cluster oxidoreductase  57.94 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  54.03 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  38 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  30 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4743  hypothetical protein  39.62 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369246  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  29.47 
 
 		 100 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>