22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5536 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5536  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  267  5e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63680  hypothetical protein  97.69 
 
 
164 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0265426  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45660  hypothetical protein  72.52 
 
 
134 aa  202  9e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0467  hypothetical protein  66.92 
 
 
151 aa  200  5e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0421  hypothetical protein  66.15 
 
 
134 aa  197  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.887447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5042  hypothetical protein  65.38 
 
 
165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438253  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4916  hypothetical protein  65.38 
 
 
134 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5092  hypothetical protein  65.38 
 
 
134 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.637088  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  66.92 
 
 
131 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0348  hypothetical protein  64.62 
 
 
145 aa  189  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3618  hypothetical protein  64.8 
 
 
155 aa  176  9e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3669  hypothetical protein  67.23 
 
 
137 aa  174  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0357  hypothetical protein  66.39 
 
 
137 aa  174  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  65.52 
 
 
119 aa  173  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0351  hypothetical protein  63.2 
 
 
137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  57.6 
 
 
137 aa  155  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  57.6 
 
 
137 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4354  Fe-S-cluster oxidoreductase  64.49 
 
 
108 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  54.4 
 
 
172 aa  147  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  55.2 
 
 
142 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  51.43 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  26.73 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>