25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0006 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 137 aa  286  8e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  99.27 
 
 		 137 aa  284  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  83.94 
 
 		 142 aa  245  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  70.68 
 
 		 172 aa  209  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3618  hypothetical protein  60.63 
 
 		 155 aa  166  7e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0351  hypothetical protein  60 
 
 		 137 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0357  hypothetical protein  60 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3669  hypothetical protein  58.46 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0348  hypothetical protein  53.44 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63680  hypothetical protein  58.4 
 
 		 164 aa  157  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  55.91 
 
 		 131 aa  155  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5536  hypothetical protein  57.6 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5042  hypothetical protein  51.97 
 
 		 165 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4916  hypothetical protein  51.97 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5092  hypothetical protein  51.97 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.637088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0421  hypothetical protein  51.15 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.887447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45660  hypothetical protein  52.24 
 
 		 134 aa  150  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0467  hypothetical protein  48.89 
 
 		 151 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  59.65 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4354  Fe-S-cluster oxidoreductase  62.39 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  36.27 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  24.73 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>