21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0467 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0467  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  315  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0348  hypothetical protein  85.82 
 
 		 145 aa  254  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0421  hypothetical protein  82.09 
 
 		 134 aa  243  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.887447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5042  hypothetical protein  81.34 
 
 		 165 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5092  hypothetical protein  81.34 
 
 		 134 aa  236  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.637088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4916  hypothetical protein  81.34 
 
 		 134 aa  236  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  78.46 
 
 		 131 aa  229  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63680  hypothetical protein  67.69 
 
 		 164 aa  201  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5536  hypothetical protein  66.92 
 
 		 130 aa  200  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45660  hypothetical protein  59.23 
 
 		 134 aa  183  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  62.61 
 
 		 119 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0351  hypothetical protein  54.76 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3618  hypothetical protein  52 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3669  hypothetical protein  53.97 
 
 		 137 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0357  hypothetical protein  53.17 
 
 		 137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  48.89 
 
 		 137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  48.89 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4354  Fe-S-cluster oxidoreductase  58.88 
 
 		 108 aa  147  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  50.39 
 
 		 172 aa  145  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  46.77 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0589  Fe-S-cluster oxidoreductase-like  40.82 
 
 		 220 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0309459  normal  0.576133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>