20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0348 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0348  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0467  hypothetical protein  85.82 
 
 		 151 aa  254  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0421  hypothetical protein  80.6 
 
 		 134 aa  238  2e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.887447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5042  hypothetical protein  80.6 
 
 		 165 aa  236  8e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  80.92 
 
 		 131 aa  236  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5092  hypothetical protein  80.6 
 
 		 134 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.637088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4916  hypothetical protein  80.6 
 
 		 134 aa  235  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63680  hypothetical protein  66.15 
 
 		 164 aa  191  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5536  hypothetical protein  64.62 
 
 		 130 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45660  hypothetical protein  58.33 
 
 		 134 aa  178  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3618  hypothetical protein  55.91 
 
 		 155 aa  166  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0351  hypothetical protein  57.03 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3669  hypothetical protein  56.35 
 
 		 137 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0357  hypothetical protein  56.35 
 
 		 137 aa  163  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  62.61 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  53.44 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  53.44 
 
 		 137 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  53.54 
 
 		 172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4354  Fe-S-cluster oxidoreductase  59.81 
 
 		 108 aa  147  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  50.81 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>