24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_63680 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_63680  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  333  5e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0265426  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5536  hypothetical protein  97.69 
 
 
130 aa  263  7e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45660  hypothetical protein  71.76 
 
 
134 aa  204  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0467  hypothetical protein  67.69 
 
 
151 aa  201  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0421  hypothetical protein  66.92 
 
 
134 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.887447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  68.46 
 
 
131 aa  196  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5042  hypothetical protein  66.15 
 
 
165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438253  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5092  hypothetical protein  66.15 
 
 
134 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.637088  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4916  hypothetical protein  66.15 
 
 
134 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0348  hypothetical protein  66.15 
 
 
145 aa  191  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3618  hypothetical protein  65.6 
 
 
155 aa  179  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3669  hypothetical protein  68.91 
 
 
137 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  67.83 
 
 
119 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0357  hypothetical protein  68.07 
 
 
137 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0351  hypothetical protein  64.8 
 
 
137 aa  175  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  58.4 
 
 
137 aa  157  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  58.4 
 
 
137 aa  157  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4354  Fe-S-cluster oxidoreductase  66.36 
 
 
108 aa  154  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  53.44 
 
 
172 aa  150  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  56 
 
 
142 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  51.43 
 
 
166 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  30.77 
 
 
104 aa  40.8  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  26.73 
 
 
141 aa  40.8  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0953  hypothetical protein  30.83 
 
 
146 aa  40.4  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0571246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>