23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3109 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  249  8.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63680  hypothetical protein  67.83 
 
 		 164 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0265426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5536  hypothetical protein  65.52 
 
 		 130 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3618  hypothetical protein  65.79 
 
 		 155 aa  169  7.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0351  hypothetical protein  65.79 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3669  hypothetical protein  64.91 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0357  hypothetical protein  64.91 
 
 		 137 aa  167  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5042  hypothetical protein  63.48 
 
 		 165 aa  166  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5092  hypothetical protein  63.48 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.637088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0467  hypothetical protein  62.61 
 
 		 151 aa  166  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0421  hypothetical protein  62.93 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.887447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4916  hypothetical protein  63.48 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0504  hypothetical protein  61.74 
 
 		 131 aa  163  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0348  hypothetical protein  62.61 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.908167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45660  hypothetical protein  61.74 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4354  Fe-S-cluster oxidoreductase  62.86 
 
 		 108 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  60.68 
 
 		 172 aa  147  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0008  hypothetical protein  58.62 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0006  protein of unknown function UPF0153  59.65 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4149  hypothetical protein  58.12 
 
 		 137 aa  144  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.675803 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  31.43 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  29.47 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  34.31 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0640158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>