25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1950 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  247  4e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  76.86 
 
 		 121 aa  193  9e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0638  hypothetical protein  59.02 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.821498  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  50 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  52.54 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  52.54 
 
 		 124 aa  131  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  50.85 
 
 		 124 aa  131  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  52.07 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  46.22 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  34.65 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  29.13 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  32.04 
 
 		 271 aa  51.6  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  32.14 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  36.26 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  29.91 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  24.1 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  26.47 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  32.32 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  29.91 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  28.44 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  24.53 
 
 		 194 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  28.72 
 
 		 172 aa  44.3  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  30 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3109  hypothetical protein  29.47 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  27.27 
 
 		 140 aa  42  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>