32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0729 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  263  8.999999999999999e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  50.81 
 
 
126 aa  142  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  55.65 
 
 
122 aa  137  4.999999999999999e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  44.54 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  47.5 
 
 
124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  45.83 
 
 
124 aa  120  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  45 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0638  hypothetical protein  44.17 
 
 
123 aa  118  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.821498  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  46.22 
 
 
122 aa  110  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  31.62 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  34.83 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  28.7 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  27.03 
 
 
194 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  31.07 
 
 
271 aa  53.5  0.0000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  27.18 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  30.63 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  31.82 
 
 
164 aa  49.7  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  27.78 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  38.75 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  28.18 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  31.25 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  26.32 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0014  hypothetical protein  28.28 
 
 
172 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  43.5  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  30.69 
 
 
273 aa  42.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  31.43 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  29.46 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  27.93 
 
 
149 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  28.74 
 
 
210 aa  41.6  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  27.78 
 
 
168 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  26.09 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  25 
 
 
281 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>