28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09358 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  333  5e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  75.93 
 
 
164 aa  240  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  57.59 
 
 
167 aa  189  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  56.96 
 
 
167 aa  188  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  58.55 
 
 
173 aa  183  7e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  48.68 
 
 
164 aa  158  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  35.26 
 
 
170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  28.22 
 
 
171 aa  84  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  32.79 
 
 
133 aa  53.9  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  29.09 
 
 
194 aa  50.8  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  29.31 
 
 
276 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  25.23 
 
 
273 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  26.5 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  31.25 
 
 
127 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  28.24 
 
 
142 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  34.88 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  32.5 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  35.79 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  30.36 
 
 
124 aa  44.7  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  35 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  28.57 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  29.46 
 
 
124 aa  42  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  34.57 
 
 
137 aa  42  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  29.55 
 
 
235 aa  41.6  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  32.93 
 
 
245 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  24.21 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  30.86 
 
 
163 aa  40.8  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  29.52 
 
 
179 aa  40.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>