52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0707 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  290  4e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  60.56 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  60.56 
 
 
163 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  59.86 
 
 
163 aa  180  6e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  58.45 
 
 
163 aa  179  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  39.02 
 
 
170 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  29.13 
 
 
179 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  30.83 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  30.43 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  29.41 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  28.92 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  24.82 
 
 
172 aa  52  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  29.31 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  29.2 
 
 
221 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  32.5 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  29.08 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  29.09 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  22.54 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  34.88 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2114  hypothetical protein  38.37 
 
 
217 aa  48.5  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.88191  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  36.46 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  34.78 
 
 
167 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  30.77 
 
 
175 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  28.06 
 
 
257 aa  47  0.00009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  33.7 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  29.84 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  37.66 
 
 
245 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  25.41 
 
 
171 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  33.72 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  33.72 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  32.29 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  34.88 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  31.25 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  33.73 
 
 
246 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2098  protein of unknown function UPF0153  30.34 
 
 
237 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  26.4 
 
 
271 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  32.32 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  31.25 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  32.32 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  32.61 
 
 
444 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  29.9 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  32.32 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  24.78 
 
 
263 aa  42.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  27.83 
 
 
244 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  32.98 
 
 
122 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  28.26 
 
 
246 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  30.91 
 
 
113 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  34 
 
 
137 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  34.65 
 
 
140 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>