41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0467 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  333  5e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  333  5e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  96.69 
 
 
163 aa  304  3e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  68.21 
 
 
163 aa  224  4e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  60.56 
 
 
142 aa  183  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  31.93 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  39.76 
 
 
170 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  34.69 
 
 
133 aa  49.7  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  31.09 
 
 
172 aa  48.9  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  27.43 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  27.42 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  36.25 
 
 
246 aa  47.8  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  25.58 
 
 
149 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  26.57 
 
 
221 aa  47.4  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  29.59 
 
 
140 aa  47  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  33 
 
 
194 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  39.51 
 
 
245 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  29.76 
 
 
175 aa  45.4  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  31.88 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  36.36 
 
 
122 aa  44.7  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  33.94 
 
 
124 aa  44.3  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  30.61 
 
 
229 aa  44.3  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  25.71 
 
 
179 aa  44.3  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  27.97 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  28.05 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  31.54 
 
 
246 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  30.59 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  30 
 
 
168 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  29.45 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  29.63 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  26.21 
 
 
444 aa  42.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  31.52 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  26.26 
 
 
186 aa  41.6  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  24.8 
 
 
271 aa  41.6  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  30.86 
 
 
164 aa  41.6  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  32.1 
 
 
164 aa  40.8  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  27.5 
 
 
218 aa  40.4  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  26.32 
 
 
222 aa  40.4  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1546  hypothetical protein  57.14 
 
 
229 aa  40.4  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.231581  hitchhiker  0.0000778031 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>