72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1445 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  43.37 
 
 		 186 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  40.23 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  37.65 
 
 		 180 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  33.91 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0165  hypothetical protein  35.06 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  30.34 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  31.21 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  34.75 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2098  protein of unknown function UPF0153  37.25 
 
 		 237 aa  74.3  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2772  protein of unknown function UPF0153  27.45 
 
 		 237 aa  67  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  28.27 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  36.27 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  38.04 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  37.11 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  33.66 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0644  hypothetical protein  35.92 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  30.05 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3209  protein of unknown function UPF0153  27.01 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.348826  normal  0.121177 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  32.61 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  36.96 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  35.16 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  30.77 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  32.22 
 
 		 124 aa  52  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  24.82 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  34.29 
 
 		 271 aa  50.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  27.39 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  30 
 
 		 222 aa  48.9  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  29.35 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  30.93 
 
 		 142 aa  48.9  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  31.09 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  31.09 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  30.85 
 
 		 257 aa  48.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  28.99 
 
 		 163 aa  47.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  29.29 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  29.66 
 
 		 273 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  30.85 
 
 		 260 aa  47.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1546  hypothetical protein  39.29 
 
 		 229 aa  47.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.231581  hitchhiker  0.0000778031 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  26 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  27.05 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0557  protein of unknown function UPF0153  26.36 
 
 		 246 aa  45.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  30.85 
 
 		 224 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  27.19 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  29.81 
 
 		 121 aa  45.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  35.11 
 
 		 126 aa  45.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  28.24 
 
 		 257 aa  44.7  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  44.3  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1409  hypothetical protein  25.19 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.722864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  34.78 
 
 		 112 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  27.55 
 
 		 122 aa  43.9  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0327  hypothetical protein  25.19 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.707104  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  26.92 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5518  hypothetical protein  39.39 
 
 		 123 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0199677  normal  0.808773 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5038  hypothetical protein  39.39 
 
 		 123 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  33.33 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0137  hypothetical protein  28.09 
 
 		 209 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.314287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  27.66 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  26.23 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0510  hypothetical protein  23.7 
 
 		 269 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  29.47 
 
 		 171 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2325  hypothetical protein  45.45 
 
 		 188 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.176439  unclonable  0.0000156265 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  27.18 
 
 		 141 aa  42  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  23.87 
 
 		 210 aa  42  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  26.03 
 
 		 148 aa  42  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  26.88 
 
 		 276 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4386  hypothetical protein  28.32 
 
 		 250 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.109165 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1853  protein of unknown function UPF0153  28 
 
 		 209 aa  41.2  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  26.09 
 
 		 127 aa  40.8  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0638  hypothetical protein  30.77 
 
 		 123 aa  40.8  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.821498  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  30.93 
 
 		 240 aa  40.8  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>