47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0471 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  467  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  58.06 
 
 
222 aa  259  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  31.9 
 
 
244 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  31.52 
 
 
303 aa  75.5  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  32.1 
 
 
258 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  32.58 
 
 
257 aa  72  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  31.47 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  31.17 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  33.08 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  28.48 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  26.01 
 
 
242 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  28.74 
 
 
263 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  30 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  27.27 
 
 
258 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  30.38 
 
 
273 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  27.27 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  25.6 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  27.67 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  36.47 
 
 
175 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  29.63 
 
 
155 aa  55.1  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  28.24 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  26.81 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  26.63 
 
 
281 aa  52.8  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  33.08 
 
 
152 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  28.68 
 
 
142 aa  52.8  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  26.09 
 
 
276 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  31.76 
 
 
149 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  34.12 
 
 
151 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  29.2 
 
 
142 aa  51.2  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  29.69 
 
 
168 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  29.21 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  26.97 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  29.69 
 
 
156 aa  50.1  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  26.57 
 
 
163 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  26.57 
 
 
163 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3209  protein of unknown function UPF0153  29.27 
 
 
230 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.348826  normal  0.121177 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  23.61 
 
 
271 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  26.95 
 
 
163 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2772  protein of unknown function UPF0153  28.95 
 
 
237 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  24.34 
 
 
163 aa  45.1  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  27.78 
 
 
172 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  30.49 
 
 
153 aa  43.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  31.58 
 
 
186 aa  43.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  27.96 
 
 
246 aa  42.4  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  26.88 
 
 
156 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  30 
 
 
444 aa  42  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>