25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2824 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  533  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  77.2 
 
 
273 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  59.68 
 
 
261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  51.98 
 
 
258 aa  266  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  37.85 
 
 
263 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  36.13 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  36.36 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  34.03 
 
 
257 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  34.03 
 
 
260 aa  156  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  34.02 
 
 
260 aa  149  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  36.55 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  34.58 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  34.06 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  35.93 
 
 
250 aa  137  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  33.47 
 
 
303 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  34.51 
 
 
240 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  31.42 
 
 
242 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  34.73 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  31.69 
 
 
276 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  27.98 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  32.1 
 
 
221 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  27.27 
 
 
222 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  28.45 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  32.5 
 
 
170 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  25.36 
 
 
155 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>