28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1215 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  543  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  73.83 
 
 		 257 aa  423  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  69.02 
 
 		 257 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  43.14 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  41.39 
 
 		 263 aa  217  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  40.08 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  38.04 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  34.84 
 
 		 250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  34.03 
 
 		 258 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  32.33 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  34.02 
 
 		 260 aa  159  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  36.56 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  34.87 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  34.62 
 
 		 244 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  31.35 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  31.54 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  31.49 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  30.59 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  28.9 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  29.81 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  26.14 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  28.48 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  36.36 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  32.41 
 
 		 194 aa  50.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  30.85 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  25 
 
 		 142 aa  42.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  26.12 
 
 		 271 aa  42  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>