31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1053 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  490  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  40.27 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  39.56 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3778  protein of unknown function UPF0153  34.48 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  38.53 
 
 		 273 aa  148  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  34.3 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  35.62 
 
 		 265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0032  protein of unknown function UPF0153  30.34 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107691  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  34.51 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  34.35 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  28.21 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  31.49 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  29.03 
 
 		 303 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  38.74 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3606  hypothetical protein  32.3 
 
 		 261 aa  115  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  32.7 
 
 		 258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  28.19 
 
 		 276 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  31.17 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  29.14 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  27.33 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  25.47 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  29.13 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  32.2 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  25.44 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  30.34 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  26.13 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  32.95 
 
 		 167 aa  42.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  29.91 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  30.34 
 
 		 124 aa  42.4  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  29.21 
 
 		 124 aa  42  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>