58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44566 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  100 
 
 
271 aa  566  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  37.7 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  30 
 
 
142 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  30.19 
 
 
155 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  31.73 
 
 
124 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  32.5 
 
 
148 aa  62.4  0.000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  35 
 
 
124 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  36 
 
 
124 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  30.28 
 
 
194 aa  59.3  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  35 
 
 
124 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  30.7 
 
 
122 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  31.07 
 
 
127 aa  53.5  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  26 
 
 
167 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  27.03 
 
 
152 aa  53.1  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  33.01 
 
 
121 aa  52.8  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  33.04 
 
 
179 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  32.04 
 
 
126 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  32.04 
 
 
122 aa  51.2  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  28.66 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  31.15 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0638  hypothetical protein  33.33 
 
 
123 aa  51.2  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.821498  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  34.29 
 
 
172 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3525  protein of unknown function UPF0153  30.26 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  27.11 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  26.79 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  27.72 
 
 
141 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  23.36 
 
 
149 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  32.41 
 
 
218 aa  47  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  29.36 
 
 
180 aa  47  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  24.77 
 
 
168 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  27.7 
 
 
173 aa  46.6  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  20.72 
 
 
156 aa  46.2  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  51.06 
 
 
138 aa  46.2  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  23.61 
 
 
221 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  25.68 
 
 
167 aa  45.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  32.65 
 
 
170 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  25.44 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  27.41 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  23.85 
 
 
175 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1735  protein of unknown function UPF0153  25.86 
 
 
324 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  24.75 
 
 
117 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  31.07 
 
 
112 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  27.97 
 
 
222 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  26.4 
 
 
142 aa  43.5  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  27.18 
 
 
153 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2665  hypothetical protein  25.18 
 
 
265 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0607651  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  26.56 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  25.6 
 
 
163 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1385  reductive dehalogenase associated protein  23.08 
 
 
181 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  30.09 
 
 
303 aa  43.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  30.3 
 
 
164 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  29.59 
 
 
164 aa  42.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0557  protein of unknown function UPF0153  26.9 
 
 
246 aa  42.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  26.96 
 
 
257 aa  42.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  26.12 
 
 
260 aa  42.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  28.43 
 
 
137 aa  42.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  27.62 
 
 
240 aa  42  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>