24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1306 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  100 
 
 		 173 aa  359  1e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  81.37 
 
 		 167 aa  281  4.0000000000000003e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  72.5 
 
 		 167 aa  244  3e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  56.33 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  56.86 
 
 		 164 aa  167  5e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  43.42 
 
 		 164 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  37.89 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  26.88 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  31.68 
 
 		 246 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  35.14 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  32.97 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  27.7 
 
 		 271 aa  46.6  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  33.73 
 
 		 113 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  33.72 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  32 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  28.57 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  33.98 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  31.52 
 
 		 124 aa  42.4  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  26.05 
 
 		 156 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  26.97 
 
 		 112 aa  41.2  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0986  hypothetical protein  30.59 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  41.2  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  29.07 
 
 		 113 aa  40.8  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  26.05 
 
 		 281 aa  40.8  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>