17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0599 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  240  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  88.39 
 
 
113 aa  216  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  86.36 
 
 
110 aa  207  6e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  32.32 
 
 
170 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  32.63 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  30.23 
 
 
167 aa  50.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  30.53 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  29.07 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  29.47 
 
 
179 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  30.19 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  29.21 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  29.59 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  31.25 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1260  hypothetical protein  24.47 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000027682  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  29.76 
 
 
163 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  29.07 
 
 
173 aa  40.8  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  27.78 
 
 
194 aa  40.4  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>