22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_567 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  239  7e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  88.39 
 
 		 113 aa  216  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  89.81 
 
 		 110 aa  208  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  32.99 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  35.05 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  31.4 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  32.63 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  30.53 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  30.23 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  33.73 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  26.97 
 
 		 156 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  29.81 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  31.63 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0986  hypothetical protein  31.37 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1260  hypothetical protein  26.32 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000027682  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  29.17 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  28.57 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1193  hypothetical protein  30.11 
 
 		 161 aa  42  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0292793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  28.89 
 
 		 194 aa  41.2  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  31.25 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  30.91 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  30.93 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>