21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2868 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 171 aa  358  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  31.48 
 
 		 170 aa  98.2  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  30.49 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  28.75 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  26.88 
 
 		 173 aa  77.4  0.00000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  25.62 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  28.22 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  26.38 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  37.08 
 
 		 194 aa  47.8  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  32.76 
 
 		 260 aa  47.8  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  25.41 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  30.34 
 
 		 110 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  30.53 
 
 		 149 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  29.81 
 
 		 113 aa  44.7  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  32.98 
 
 		 222 aa  44.3  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  28.89 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  29.47 
 
 		 112 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  28.89 
 
 		 263 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  29.47 
 
 		 172 aa  42  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  30.34 
 
 		 179 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  20.9 
 
 		 271 aa  40.8  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>