36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1430 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  344  3e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  81.37 
 
 
173 aa  281  4.0000000000000003e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  72.67 
 
 
167 aa  254  3e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  57.59 
 
 
163 aa  174  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  57.89 
 
 
164 aa  173  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  45.39 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  33.33 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  28.75 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  30.28 
 
 
194 aa  50.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  35.71 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1266  protein of unknown function UPF0153  31.07 
 
 
246 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0986  hypothetical protein  32.94 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  34.78 
 
 
142 aa  48.1  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  31.87 
 
 
110 aa  48.1  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5420  hypothetical protein  28.83 
 
 
290 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  30.23 
 
 
113 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  29.21 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  34.57 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  29.07 
 
 
113 aa  45.1  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  25.68 
 
 
271 aa  45.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  20.74 
 
 
263 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  28.81 
 
 
281 aa  44.3  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  30.51 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2310  hypothetical protein  36.84 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.433351  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  32.97 
 
 
124 aa  43.9  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0617  protein of unknown function UPF0153  29.06 
 
 
242 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00612385 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0824  hypothetical protein  31.76 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  31.73 
 
 
245 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  26.89 
 
 
273 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  32.22 
 
 
224 aa  41.6  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0724  hypothetical protein  42.11 
 
 
231 aa  41.6  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.394477  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  28.92 
 
 
175 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  31.48 
 
 
258 aa  41.2  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2609  hypothetical protein  42.11 
 
 
235 aa  40.8  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0632  hypothetical protein  65.22 
 
 
244 aa  40.8  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1780  hypothetical protein  29.66 
 
 
251 aa  40.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>