18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0986 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0986  hypothetical protein  100 
 
 
163 aa  334  2.9999999999999997e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1925  hypothetical protein  38.01 
 
 
190 aa  110  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495602  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1994  hypothetical protein  36.55 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0604  hypothetical protein  35.26 
 
 
160 aa  84.3  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.858463 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1628  hypothetical protein  31.65 
 
 
160 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.534444  normal  0.0178441 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2444  hypothetical protein  36.72 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1193  hypothetical protein  26.09 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0292793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0140  hypothetical protein  29.92 
 
 
167 aa  60.5  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1260  hypothetical protein  35.05 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000027682  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1529  hypothetical protein  34.26 
 
 
176 aa  50.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2397  hypothetical protein  35.56 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  32.94 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0825  hypothetical protein  27.12 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772025  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  30.43 
 
 
167 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  30.39 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  28.3 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  31.37 
 
 
113 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  30.59 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>