16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1260 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1260  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  296  7e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000027682  normal  0.177226 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0604  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  103  8e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.858463 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1628  hypothetical protein  41.05 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.534444  normal  0.0178441 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0140  hypothetical protein  34.29 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0825  hypothetical protein  41.98 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00772025  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2444  hypothetical protein  44.93 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1529  hypothetical protein  31.68 
 
 
176 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2397  hypothetical protein  31.11 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0986  hypothetical protein  35.05 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.255256  normal  0.2997 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1193  hypothetical protein  25.81 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0292793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1925  hypothetical protein  30.21 
 
 
190 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.495602  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  26.6 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  26.32 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1994  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  27.19 
 
 
271 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  24.47 
 
 
113 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>