60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0749 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  29.87 
 
 
168 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  42.7 
 
 
133 aa  59.7  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  31.03 
 
 
167 aa  59.7  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  30.28 
 
 
271 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  36.36 
 
 
156 aa  58.2  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  27.03 
 
 
127 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  34.4 
 
 
137 aa  55.8  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  31.78 
 
 
166 aa  55.1  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  28.24 
 
 
221 aa  54.7  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  27.89 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  28.89 
 
 
149 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  30.77 
 
 
137 aa  51.6  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  51.6  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  34.45 
 
 
210 aa  51.2  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  32 
 
 
141 aa  51.2  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  33.63 
 
 
170 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09358  hypothetical protein  29.09 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125242  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1430  hypothetical protein  30.28 
 
 
167 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000892693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  31.25 
 
 
142 aa  50.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1215  hypothetical protein  32.46 
 
 
260 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000145347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  29.55 
 
 
151 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  27.27 
 
 
164 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  28.97 
 
 
126 aa  48.9  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  31.21 
 
 
153 aa  48.5  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  31.82 
 
 
175 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  32.65 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  37.08 
 
 
171 aa  47.8  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  34.04 
 
 
240 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  26.14 
 
 
124 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  26.14 
 
 
124 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0985  protein of unknown function UPF0153  31.63 
 
 
245 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0091642 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  31.3 
 
 
257 aa  47.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0460  hypothetical protein  26.11 
 
 
256 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  33.67 
 
 
163 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  32.18 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 
218 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  33.67 
 
 
163 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  26.13 
 
 
124 aa  46.2  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  33 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  30.97 
 
 
148 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  30 
 
 
110 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1306  Fe-S-cluster oxidoreductase  28.57 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.214634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  30.43 
 
 
112 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0437  hypothetical protein  32.38 
 
 
260 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.493907  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  26.14 
 
 
124 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  26.14 
 
 
122 aa  45.1  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  27.88 
 
 
140 aa  44.3  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3467  hypothetical protein  31.53 
 
 
220 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  28.41 
 
 
122 aa  43.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  25.13 
 
 
246 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  26.97 
 
 
156 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0638  hypothetical protein  31.91 
 
 
123 aa  42.7  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.821498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  28.7 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0871  hypothetical protein  28.7 
 
 
303 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.469747  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  30 
 
 
152 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  28.89 
 
 
113 aa  41.2  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  24.53 
 
 
121 aa  41.6  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  31.03 
 
 
138 aa  41.2  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>