60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0986 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  63.64 
 
 		 175 aa  191  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  58.78 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  58.11 
 
 		 168 aa  183  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  55.71 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  52.48 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  29.52 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  36.47 
 
 		 222 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  32.61 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  34.23 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  30.41 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  28.89 
 
 		 194 aa  52.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  31.76 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  28.3 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  28.92 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  34.09 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  31.19 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  32.04 
 
 		 250 aa  51.6  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  31.91 
 
 		 281 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  34.94 
 
 		 112 aa  50.1  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  32.95 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  32.95 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  29.73 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  29.7 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  26.92 
 
 		 222 aa  48.1  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  23.36 
 
 		 271 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  25.58 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  25.58 
 
 		 163 aa  47.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  32.65 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  26.97 
 
 		 163 aa  47  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  26.19 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  28.92 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  29.67 
 
 		 224 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  30.1 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  23.64 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2868  protein of unknown function UPF0153  30.53 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.557479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  24.42 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  21.82 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1054  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.212731 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  23.13 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  34.02 
 
 		 122 aa  43.5  0.0009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  22.32 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  24.69 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  30.53 
 
 		 237 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1053  hypothetical protein  25.24 
 
 		 240 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.115191 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  27.93 
 
 		 127 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  26.13 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0358  protein of unknown function UPF0153  27.55 
 
 		 258 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1831  protein of unknown function UPF0153  26.19 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0953525 
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  25.53 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1694  hypothetical protein  29.13 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  23.58 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  27.45 
 
 		 240 aa  40.8  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  27.37 
 
 		 246 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  27.84 
 
 		 121 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1625  hypothetical protein  27.05 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0259974 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2621  hypothetical protein  32.47 
 
 		 244 aa  40  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  22.11 
 
 		 273 aa  40  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>