47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1303 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  347  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  65.56 
 
 		 151 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  63.27 
 
 		 175 aa  202  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  58.11 
 
 		 149 aa  183  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  50.34 
 
 		 152 aa  159  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  49.04 
 
 		 156 aa  155  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  35.71 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  29.87 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  32.79 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  25.71 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  29.25 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  36.36 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  28.85 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  29.69 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  34.48 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  27.39 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  29.03 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 		 126 aa  49.3  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  35.71 
 
 		 122 aa  47.8  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0626  hypothetical protein  30.11 
 
 		 110 aa  47.4  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000851469  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  28.81 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  24.77 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0146  hypothetical protein  35.79 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0057515  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  26.73 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  33.7 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  25.69 
 
 		 124 aa  45.8  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  28.45 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  25.89 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  29.5 
 
 		 250 aa  44.7  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  29.51 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  31.82 
 
 		 124 aa  44.3  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  29.36 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  34.74 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  34.74 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0599  hypothetical protein  29.59 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000657339  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1914  hypothetical protein  33.33 
 
 		 281 aa  43.9  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  30 
 
 		 224 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  27.78 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_567  hypothetical protein  28.57 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1625  hypothetical protein  32.69 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0259974 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  27.03 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  24.88 
 
 		 224 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  30.95 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  23.38 
 
 		 218 aa  40.8  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  27.78 
 
 		 127 aa  40.8  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>