44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0737 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  360  8e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  45.29 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  44.32 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  37.65 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0165  hypothetical protein  41.89 
 
 		 200 aa  96.3  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  34.47 
 
 		 224 aa  91.3  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2772  protein of unknown function UPF0153  32.56 
 
 		 237 aa  91.3  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  35.86 
 
 		 218 aa  90.5  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  32.2 
 
 		 236 aa  87.4  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  30.3 
 
 		 268 aa  85.1  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  41.67 
 
 		 237 aa  67.8  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  36.27 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3209  protein of unknown function UPF0153  26.98 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.348826  normal  0.121177 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  27.49 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  30.29 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2098  protein of unknown function UPF0153  38.38 
 
 		 237 aa  60.8  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0644  hypothetical protein  35.45 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0557  protein of unknown function UPF0153  30.04 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  30.41 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  29.41 
 
 		 142 aa  53.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  35.34 
 
 		 155 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  26.97 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  33.62 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  32.09 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  28.85 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  28.85 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  26.72 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  29.36 
 
 		 271 aa  47  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  30.77 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  27.97 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1650  hypothetical protein  25.86 
 
 		 242 aa  44.7  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  29.51 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  25.69 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  30.33 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  23.23 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1546  hypothetical protein  43.64 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.231581  hitchhiker  0.0000778031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  25.23 
 
 		 224 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  28.1 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  26.61 
 
 		 156 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1741  protein of unknown function UPF0153  28.57 
 
 		 250 aa  42  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00416272  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  29.55 
 
 		 142 aa  41.6  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  27.96 
 
 		 122 aa  41.6  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3505  protein of unknown function UPF0153  28.3 
 
 		 444 aa  41.6  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.100361  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  27 
 
 		 222 aa  41.6  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>