22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1302 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  100 
 
 
224 aa  442  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2772  protein of unknown function UPF0153  74.79 
 
 
237 aa  338  2.9999999999999998e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3209  protein of unknown function UPF0153  65.68 
 
 
230 aa  286  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.348826  normal  0.121177 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0557  protein of unknown function UPF0153  66.94 
 
 
246 aa  282  4.0000000000000003e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  66.19 
 
 
218 aa  262  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  37.13 
 
 
186 aa  99.4  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  34.47 
 
 
180 aa  91.3  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  29.21 
 
 
268 aa  84.7  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  32.42 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0165  hypothetical protein  33.94 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  30.2 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  28.27 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  27 
 
 
229 aa  55.8  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  28.36 
 
 
237 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  27.14 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  30 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  29.46 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0087  hypothetical protein  30.1 
 
 
133 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  27.41 
 
 
271 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0644  hypothetical protein  24.24 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  23.26 
 
 
153 aa  42  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2098  protein of unknown function UPF0153  27.01 
 
 
237 aa  41.6  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>