20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1377 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  426  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  28.21 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  30.4 
 
 
179 aa  52.8  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  28.57 
 
 
142 aa  52  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  26.97 
 
 
180 aa  52  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  25 
 
 
222 aa  51.6  0.000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  34.45 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  26.49 
 
 
156 aa  49.7  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  26.7 
 
 
153 aa  48.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  23.93 
 
 
222 aa  45.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  25.93 
 
 
166 aa  45.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  21.83 
 
 
246 aa  45.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1651  hypothetical protein  41.27 
 
 
138 aa  45.4  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.396614  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  27.05 
 
 
117 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  27.56 
 
 
155 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  23.13 
 
 
149 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  29.1 
 
 
140 aa  42.4  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  23.87 
 
 
172 aa  42  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  28.74 
 
 
127 aa  41.6  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2337  protein of unknown function UPF0153  31.82 
 
 
273 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>