43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0012 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0012  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  320  3e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  42.42 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  41.27 
 
 
166 aa  104  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1540  hypothetical protein  33.08 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  30.19 
 
 
271 aa  77.8  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  36.19 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1893  protein of unknown function UPF0153  40.23 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  32.71 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  30.77 
 
 
175 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  29.52 
 
 
149 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  35.42 
 
 
222 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1656  protein of unknown function UPF0153  27.27 
 
 
124 aa  58.9  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  31.73 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  35.16 
 
 
172 aa  55.1  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  31.82 
 
 
122 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0471  hypothetical protein  29.63 
 
 
221 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  28.85 
 
 
168 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  35.34 
 
 
180 aa  53.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  27.88 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1006  protein of unknown function UPF0153  29.52 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0180837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20040  predicted Fe-S-cluster oxidoreductase  38.37 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000345042  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  27.18 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0707  hypothetical protein  29.31 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195135  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  36 
 
 
179 aa  48.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1950  hypothetical protein  24.1 
 
 
122 aa  47.4  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00178509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  32.98 
 
 
186 aa  45.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  31.25 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  27.97 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1951  protein of unknown function UPF0153  26.42 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  27.78 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1442  hypothetical protein  30.25 
 
 
273 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  28.7 
 
 
124 aa  44.3  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  27.56 
 
 
210 aa  44.3  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  27.97 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1904  hypothetical protein  28.03 
 
 
222 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0785704  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  27.97 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2824  hypothetical protein  25.36 
 
 
258 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  31.87 
 
 
229 aa  42.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2888  hypothetical protein  27.71 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2472  hypothetical protein  26.17 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  31.87 
 
 
237 aa  41.2  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0484  hypothetical protein  24.14 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  30.84 
 
 
194 aa  40.4  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>